Nei soggetti con X Fragile sono presenti: difficoltà cognitive, che si esprimono con ritardo mentale, ed incapacità nell’elaborare adeguatamente le informazioni sensoriali;
scarso tono muscolare, scarso senso dell'equilibrio. difficoltà nel mantenere l'attenzione, iperattività e impulsività, difficoltà nell'apprendimento, disagio a sostenere il contatto visivo, disagio a essere toccati.
Spesso, è presente anche un ritardo del linguaggio, che può presentare caratteristiche specifiche: ripetizione di parole e frasi (ecolalia), una tendenza a cambiare rapidamente da un tema ad un altro durante una conversazione, scarso controllo del ritmo (disritmia); può essere presente anche una difficoltà nella comprensione del linguaggio parlato.